植物研究所高性能計算機群是一個具有海量存儲能力和超級計算能力的高性能計算環(huán)境，包括登錄結點池、計算資源池以及存儲資源池等。
高性能計算用戶可以利用WEB、應用集成GUI以及Scripts三種方式連接到集群登錄結點提交作業(yè)，并通過全局共享的并行存儲資源池存儲應用程序的輸入文件和輸出結果：
由于生物研究的特殊性，機群的整體安全性和可管理性非常重要，所以，集群采用的曙光DCSM機群安全模塊源于智能防火墻技術，其核心思想是為機群系統(tǒng)的使用增加一道管理屏障。DCSM專門針對機群按進行了優(yōu)化，在軟件設計上增強了機群系統(tǒng)的接入控制和安全管理功能，使之與機群產(chǎn)品有機結合，從而更好地發(fā)揮機群網(wǎng)絡安全門戶的作用。
訪問控制：非法用戶無法入侵，不批準連門您都摸不著?！?安全隔離：外網(wǎng)病毒、木馬、以及入侵等惡意行為可以安全過濾防護。
節(jié)點映射：可以在安全的情況下與外界進行數(shù)據(jù)交互，如在線下載補丁包，上傳特定數(shù)據(jù)。
遠程安全接入：可以從遠程撥號接入分中心，即使通過互聯(lián)網(wǎng)絡也可以安全地訪問和管理機群。
安全管理：機群安全模塊為機群增加了一個有效的網(wǎng)絡安全策略管理的平臺，提高機群應用的安全性。
日志統(tǒng)計：對任何進入機群節(jié)點的操作以及DCSM系統(tǒng)相關配置，都有詳細的日志統(tǒng)計、審計，日志結果可按照IP、時間、流量等相關元素排序、統(tǒng)計、查詢等操作，也可以報表、文本等多種格式輸出。
除了安全性能，在散熱設計上為了滿足植物研究所超高密的系統(tǒng)散熱要求，服務器內(nèi)部設計了多處專用散熱通道，每個通道保障不同部件的散熱。通過獨立散熱通道，對部分發(fā)熱量的部件形成隔離空間，強制形成前后空氣對流，避免對周圍部件的散熱影響。
植物研究所采用的曙光CB85-F服務器，EP850-GF2服務器作為計算結點，峰值性能為10.3Tflops。
CB85-F是最新研發(fā)的新一代刀片式服務器產(chǎn)品，并專為HPC進行優(yōu)化設計，單結點linpack效率超過85%。四顆處理器通過AMD Hypertransport總線直接實現(xiàn)互聯(lián)，互聯(lián)帶寬高達8GB/s。每個處理器通過集成的內(nèi)存控制器訪問四通道內(nèi)存系統(tǒng)，能夠極大的滿足研究所的運算需求。
植物研究所超級計算機群系統(tǒng)具備業(yè)界頂尖的管理、診斷系統(tǒng)設計。全新管理平臺包括內(nèi)嵌于服務器結點的高集成度服務器硬件控制單元、機柜智能監(jiān)控系統(tǒng)以及功能全面的管理軟件系統(tǒng)Gridview和PowerConf(曙光研發(fā)的服務器專用管理軟件)，如下圖所示：
曙光Gridview v2.0服務器綜合管理系統(tǒng)統(tǒng)一告警平臺系統(tǒng)圖示
植物研究所在應用中測試發(fā)現(xiàn)，使用曙光Powerconf節(jié)能，效率能達到20%左右：
植物研究所采用的10萬億次高性能計算集群系統(tǒng)占用5個機柜空間，考慮到未來一段時間的擴展需求，曙光還為研究所專門作了機房設計、配置和布局：
該植物研究所表示：西南戰(zhàn)略生物資源超級計算分中心的建立，對我國植物及生物研究領域的貢獻不可估量。感謝曙光高性能計算在生物研究領域多年來積累的豐富經(jīng)驗，正是出色的技術實力和行業(yè)經(jīng)驗的結合，解決了中科院某植物研究所的系統(tǒng)需求與實際應用的需求。
