在新冠病毒的刺突蛋白序列上的計算機模擬實驗表明,LinearDesign能夠設(shè)計出結(jié)構(gòu)最穩(wěn)定的序列,而且設(shè)計時間只需要1個半小時。如果采用線性時間近似算法,所需時間可以進一步縮短到11分鐘。對此,羅徹斯特大學(xué)教授、RNA生物中心主任David Mathews給出了極高的評價:“LinearDesign算法設(shè)計了一組結(jié)構(gòu)更穩(wěn)定的序列,并使用翻譯效率高的密碼子,它高效的運行速度是序列設(shè)計的關(guān)鍵,這些設(shè)計序列可以通過實驗檢驗它們作為疫苗的效果?!?/p>
解決困擾世界難題LinearDesign是基于今年1月底百度研究院對外開放的線性時間算法LinearFold升級而來。LinearFold預(yù)測RNA二級結(jié)構(gòu)的速度堪稱全球最快,整個分析時間能夠從55分鐘縮短至27秒,提速120倍。
其實,百度研究院用人工智能技術(shù)開展基因分析、RNA二級結(jié)構(gòu)相關(guān)的研究可以追溯到更早。吳甜在盛典中談到,“百度在AI領(lǐng)域深耕和布局多年,積累了非常深厚的AI技術(shù)能力。百度研究院早在2018年就開始研究LinearFold、LinearPartition等算法,希望與不同領(lǐng)域進行深度的融合,助力產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)型發(fā)展”。 這些研究成果在業(yè)內(nèi)受到廣泛重視,并相繼被計算生物學(xué)領(lǐng)域頂級會議ISMB接收。
吳甜表示,LinearDesign算法是百度AI技術(shù)在生命科學(xué)研究方向上極具代表性的一次嘗試,也是百度AI技術(shù)積累及經(jīng)驗的產(chǎn)物。疫情爆發(fā)后百度研究院第一時間成立專項技術(shù)小組,開展了一系列的AI、生物抗疫工作。短短3個月,完成了新的LinearDesign 的mRNA設(shè)計算法,并且獲得了多個疫苗公司和機構(gòu)的關(guān)注和合作意向。1月底2月初,為了支持國家抗疫工作,百度派駐專人到中國疾病預(yù)防控制中心,進行專項跟進,支持抗疫工作。在此過程中,百度發(fā)現(xiàn),AI能力和生物信息的緊密聯(lián)合,在病毒分析、疫苗研發(fā)方面對中國疾病預(yù)防控制中心有非常重要的價值。因此,百度牽頭與中國疾病預(yù)防控制中心聯(lián)合成立了”中國CDC應(yīng)急技術(shù)中心-百度基因測序工作站”,展開長期戰(zhàn)略性抗疫支持工作。
今年6月,北京新發(fā)地突發(fā)疫情時,CDC工作站在樣本接收后10個小時即完成了北京四個樣本的全基因組測序,功不可沒。中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所病毒病應(yīng)急技術(shù)中心主任、博士研究員譚文杰表示:“我們想把百度在mRNA二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測上的優(yōu)勢,轉(zhuǎn)化成將來疫苗的生產(chǎn)和研發(fā)。未來還能服務(wù)于其他任何未知的、新發(fā)的傳染病的防控?!眳翘鹨舱劦?,百度將在深度和廣度兩個維度上,繼續(xù)依托在AI算法領(lǐng)域的深耕優(yōu)勢,深化與學(xué)術(shù)界和生物制藥企業(yè)的合作。
百度AI在此次疫情中的快速響應(yīng),側(cè)面反映了其前沿技術(shù)實力與行業(yè)深度結(jié)合的能力。吳甜透露,新算法的研究借鑒了自然語言處理技術(shù)(NLP)領(lǐng)域的算法思想,而百度在NLP領(lǐng)域有非常深厚的積累和沉淀。吳甜作為百度NLP十年發(fā)展參與者和見證者之一,投身參與了各種AI核心技術(shù)、產(chǎn)品的研究與發(fā)展,在AI技術(shù)與產(chǎn)業(yè)的相互促進的過程中,百度擁有越來越多優(yōu)質(zhì)產(chǎn)品及技術(shù)成果。
關(guān)于人工智能未來發(fā)展,吳甜表示,各行各業(yè)都在AI技術(shù)的紅利中享受產(chǎn)業(yè)融合帶來的全新價值。比如智能客服,它可以提供親切、耐心和專業(yè)的客戶服務(wù);醫(yī)療領(lǐng)域,AI技術(shù)助力醫(yī)護人員,為病患提供更優(yōu)質(zhì)的服務(wù)??梢灶A(yù)見,隨著新技術(shù)的加持,如百度大腦、飛槳等AI平臺在更加廣泛的應(yīng)用,各行各業(yè)都可以擁有平臺化、生態(tài)化的生產(chǎn)模式,加速各產(chǎn)業(yè)智能化進程。正如百度CTO王海峰在2020中國互聯(lián)網(wǎng)大會中所講,百度正在利用領(lǐng)先的AI技術(shù)幫助企業(yè)建立競爭優(yōu)勢,并支持中國制造業(yè)實現(xiàn)智能化升級。