中國科學報 發(fā)表于:14年10月15日 11:00 [綜述] DOIT.com.cn
為了馴服生物實驗室辛苦得出的數(shù)據(jù)洪流,美國國立衛(wèi)生研究院(nih)近日宣布,今年投資3200萬美元設立一個獎項,以推動研究人員開發(fā)分析和使用生物學大數(shù)據(jù)庫的方法。
該獎項出自nih去年啟動的大數(shù)據(jù)知識(bd2k)創(chuàng)新計劃。nih認為應當投入更多資源幫助使用不斷增長的數(shù)據(jù)集——生物醫(yī)學研究者積累的基因、蛋白質和患者檔案等數(shù)據(jù)。例如,在一個“干生物學”項目中,研究人員將細胞基因表達的公共數(shù)據(jù)和患者檔案混合在一起,預測現(xiàn)存藥物的新用途。
bd2k獎項“將幫助我們克服最大化利用數(shù)據(jù)洪流面臨的障礙,而且目前數(shù)據(jù)積累速度正在加速。”nih院長franciscollins在新聞發(fā)布會上說。他表示,這些獎金將資助開發(fā)計算工具、軟件、標準和方法,用于分享和使用大數(shù)據(jù)集。
在未來4年里,11個卓越創(chuàng)新中心每年將收到200萬~300萬美元,開發(fā)從建模癌癥細胞信號到整合移動傳感器數(shù)據(jù)等各個方面所需的方法和工具。另一個獎項將資助名為enigma的全球腦數(shù)據(jù)收集工作,從而發(fā)掘精神疾病的遺傳根源。
最近加入enigma項目的佛蒙特大學認知神經學家hughgaravan表示,長期以來,神經影像研究也在與數(shù)據(jù)不足作斗爭。他提到,約“95%的影像學研究可能每組有20個參與者”,主要原因是腦掃描成本——每人約為500~600美元。garavan研究小組則計劃使用數(shù)據(jù)池探索成癮性的基因和神經生物學基礎。
另一方面,盡管大數(shù)據(jù)集增加了獲得假陽性結果和錯過稀有變體的概率,但總體而言,數(shù)據(jù)池策略“非常有意義”,西雅圖兒童醫(yī)院精神病學家jackmcclellan說。
bd2k項目還將資助加州大學圣迭戈分校建立一個“數(shù)據(jù)探索”協(xié)調中心,該中心將與其他8個機構聯(lián)合開發(fā),從而幫助研究人員更容易地發(fā)現(xiàn)和使用數(shù)據(jù)集。
這一舉措不僅有利于生物學研究,對醫(yī)療的推動也將產生巨大貢獻,為未來生物學、醫(yī)學發(fā)展提供更加快捷的道路。